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《基因芯片数据分析与处理》

编写人员

主编李瑶

副主编贺佳陈一东曹勇伟许可

参编人员以姓氏笔画为序

( )

付旭平复旦大学生命学院遗传所

( )

刘三震上海博星基因芯片有限责任公司

( )

许可美国公司

( Pfizer )

孙美倩复旦大学生命学院遗传所

( )

李平美国公司

( Monsanto )

李瑶复旦大学生命学院遗传所

( )

杨晓美国公司

( Monsanto )

吴海复旦大学生命学院遗传所

( )

吴骋第二军医大学统计教研室

( )

陈一东

(NationalHumanGenomeResearchInstitute,

美国

NationalInstituteofHealth, )

贺佳第二军医大学统计教研室

( )

贺宪民第二军医大学统计教研室

( )

曹勇伟美国公司

( Monsanto )

魏庆复旦大学生命学院遗传所

( )

前言

基因芯片技术是交叉性很强的学科,它不仅体现在实验技术本身所涉及的众多领域,如

物理、化学、材料、生物等,而且在数据挖掘方面需要数学、统计学、计算机科学、生物学

和医学方面的专业人才,需要不同学科的研究者共同努力,尤其需要生物学家和计算科学家

通过“双边对话”共同完成实验设计、实验方法改进以及数据分析和阐明。生物学家必须依

赖从事计算的人员来发展计算方法,而计算工作者也依赖生物工作者提供实验数据,不同学

科研究人员之间的沟通需要复合型人才,然而目前复合型人才非常缺乏。

基因芯片数据挖掘方面已有不少英文版著作出版,但笔者还未见有相关的中文著作,因

此我们认为有必要编写一本中文的参考书。编写这本书的目的就在于通过对基因芯片技术及

数据分析的基本原理的深层描述,培养有多种技能的复合型人才,从提出生物学命题开始,

经过合理的实验设计、实验流程,进行数据挖掘,以期解决相关领域的生物学命题。我们在

统计分析方法方面作了重点的介绍,使生物学家和计算科学工作者都能从中获得他们各自所

需的信息。使学统计的人能对生物学和芯片技术有大致的了解,也使生物学或医学领域的研

究者能大致了解基因芯片中所涉及的统计学知识。这本书针对双方各自的需求,希望能成为

“催化剂”,降低学科间对话的难度,促使双方更好地交流。但本书的阐述更偏重于数据分析

和处理的部分,这是因为目前我们还没有发现有同类的中文书籍出版。

本书共分为十六章

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